Bioinformaticien(Ne) de Recherche Niveau 3

**Description de l’établissement**:
Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre hospitalier mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique. Associé à l'Université de Montréal, le CHU Sainte-Justine est de loin le plus grand centre de formation en pédiatrie au Québec et un chef de file au Canada. Chaque jour, ce sont près de 7 000 personnes engagées - spécialistes en soins infirmiers, en réadaptation physique, en santé psychosociale, en recherche et en administration, médecins, dentistes, pharmaciennes et pharmaciens, stagiaires et bénévoles - qui, inspirées par une tradition d’innovation, collaborent afin de transformer la vie de générations.

**Description du poste**:
Le CHUSJ et l’Hospital for Sick Children (SickKids) de Toronto ont récemment mis sur pied un partenariat de recherche qui vise à transformer les soins pédiatriques via le développement de nouveaux paradigmes en santé de précision. Ce partenariat sans précédent dans l’histoire canadienne s’appuiera sur la création de synergies centrées sur l’utilisation de technologies de pointe et le partage et l’exploitation de grands jeux de données. Le CHUSJ recherche un bioinformaticien pour soutenir le développement du volet de génomique translationnelle de ce partenariat.

**Le bioinformaticien aura la responsabilité de**:

- Mettre en place des pipelines qui permettent d’identifier, annoter et analyser des variants génétiques et épigénétiques à partir de données de séquençage (génome complet et transcriptome). Les données à analyser proviendront du séquençage de courte lecture (systèmes NovaSeq 6000 et NovaSeq X Plus d’Illumina) et de longue lecture (systèmes Revio de PacBio et Promethion d’Oxford Nanopore);
- Réaliser différentes analyses bioinformatiques à partir des jeux de données générés par les séquenceurs de nouvelle génération;
- Organiser les réunions de l’équipe de projet, participer aux décisions opérationnelles et aider à la rédaction des articles et publication des projets;
- S’assurer de la bonne marche de l’étude, du suivi du protocole et de la qualité des données ;
- Développement et rédaction des procédures de traitement des données dans le laboratoire, ainsi que la mise en place du système d’analyse;
- Organisation, hiérarchisation et archivage des données sur les serveurs;
- Documentation et communication sur le processus d’analyse, résultats, outils et techniques utilisés;
- Interaction avec les membres du laboratoire afin d’élaborer des stratégies d’analyses.

**Exigences**:

- Niveau d’études : Diplôme universitaire en bioinformatique ou dans un domaine pertinent;
- Expérience en programmation avec les langages Bash et Python dans un environnement Linux;
- Connaissance et/ou expérience avec NextFlow, YAML ou WDL;
- Expérience en processus d’analyse sur des grappes de calculs HPC ou infonuagiques;
- Expérience avec des banques de données SQL;
- Proactif et capable de travailler de façon indépendante avec supervision mínimale;
- Capacité de travailler en groupe sur plusieurs projets;
- Excellente gestion des priorités, rapidité d’exécution, sens de l’organisation et gestion du temps;
- Bonne compétence en gestion de données.

**Conditions d’emploi**
Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR)
Échelle salariale: Niveau 3 - entre 28.67$/hr et 42.58$/hr
Chercheur responsable: Dr Jacques Michaud
Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)
Date prévue d’entrée en fonction : Immédiate
- Remarques : _

Autres avantages:
**FAIRE CARRIÈRE CHEZ NOUS C’EST**:

- Contribuer à une mission humaine qui a pour but d’améliorer la santé des mères et des enfants du Québec;
- S’investir avec une équipe de travail innovatrice, motivée par des projets en constante évolution;
- Avoir la possibilité de se réaliser à travers des défis stimulants;
- S’offrir une carrière à la hauteur de ses compétences dans un milieu constamment en mouvement;
- Évoluer dans une organisation qui valorise l’amélioration continue;
- Se réaliser professionnellement grâce aux multiples possibilités de développement.

Type d'emploi : Temps plein

Rémunération : 28,67$ à 42,58$ par heure

Avantages:

- Assurance Dentaire
- Assurance Invalidité
- Assurance Maladie Complémentaire
- Assurance Vie
- Congés payés
- Garderie sur Place
- Programme d'Aide aux Employés
- Programmes de Bien-être
- Stationnement sur place

Horaires de travail:

- Quart de jour

Lieu du poste : En présentiel