Bioinformaticien(Ne) de Recherche Niveau 4

7 months ago


Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

**Description de l’établissement**
Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre hospitalier mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique. Associé à l'Université de Montréal, le CHU Sainte-Justine est de loin le plus grand centre de formation en pédiatrie au Québec et un chef de file au Canada. Chaque jour, ce sont près de 7 000 personnes engagées - spécialistes en soins infirmiers, en réadaptation physique, en santé psychosociale, en recherche et en administration, médecins, dentistes, pharmaciennes et pharmaciens, stagiaires et bénévoles - qui, inspirées par une tradition d’innovation, collaborent afin de transformer la vie de générations.

**Projet**
Laboratoire de recherche du Dr Sébastien Jacquemont.

**Description du poste**
Le bioinformaticien/Data-Manager devra identifier, annoter et analyser des variants génétique à partir de données de génotypage et de séquençage (exome et génome complet). Le projet explore l’impact de variants génétiques sur la cognition, le comportement et les traits psychiatriques et neurodéveloppementaux. Il devra également superviser le travail des autres bioinformaticiens du laboratoire et de tous les étudiants qui travaillent sur les données disponibles sur les serveurs. Il sera responsable de l’organisation des données, de l'optimisation des protocoles d’analyse et des pipelines développés au laboratoire en collaboration avec les autres membres de l’équipe.
- Identification, annotation, analyse de variants génomiques structurels. Les data à analyser comprennent des données de génotypage sur 800 000 individus et des données de séquençage (exome et génome complet) sur environ 150 000 individus;
- Supervision d’étudiants travaillant sur les données générées (accès, partage et respect des bonnes procédures);
- Gestion et coordination du travail en bio-informatique du laboratoire;
- Développement et rédaction des procédures de traitement des données dans le laboratoire;
- Organisation et hiérarchisation des données sur les serveurs (Compute Canada);
- Documentation et communication sur le processus d’analyse, résultats, outils et techniques utilisés;
- Interaction avec les membres du laboratoire afin d’élaborer des stratégies d’analyses.Exigences :Exigences et aptitudes:

- Bonne connaissance des langages de Scripting (Python, PHP, Bash) ou de programmation (Java, C++, MATLAB);
- Connaissance avec le système d'exploitation Linux;
- Une certaine expérience avec les bases de données relationnelles (MySQL, PostgreSQL, ElasticSearch);
- Connaissance des méthodes statistiques de base et du langage R;
- Expérience en programmation dans le domaine de la bio-informatique;
- Bilinguisme;
- Niveau d’études : PhD en bioinformatique, en génomique ou en informatique avec de solides connaissances en génétique;
- Capacité de travailler en groupe sur plusieurs projets;
- Bonne compétence en « Data management »;
- Expérience en gestion de projets et de personnel;
- Expérience de travail sur les clusters de calculs.

**Conditions d’emploi**
Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR)
Échelle salariale: Niveau 4 - entre 32.11$/hr et 47.70$/hr
Chercheur responsable: Dr Sébastien Jacquemont
Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)
Date prévue d’entrée en fonction : Dès que possible

Avis important
- Remarques _

**Autres avantages**
Au CHU Sainte-Justine, nous sommes animés par des valeurs organisationnelles qui définissent notre philosophie de gestion et qui encadrent nos actions. Les valeurs qui nous unissent sont la bienveillance, la quête de l’excellence, le partenariat et l’engagement individuel et collectif.

Lorsque vous travaillez au CHU Sainte-Justine, vous faites partie d'une grande famille dédiée au bien-être des mères et des enfants. Voici d'autres avantages dont vous bénéficierez:
Des établissements facilement accessibles:

- Station de métro, lignes d'autobus et grands axes routiers à proximité
- Abri à vélos sécurisé

Des services sur place pour vous simplifier la vie:

- Centre de la petite enfance Sainte-Justine
- Nettoyeur et service de couture
- Activités sportives
- Service alimentaire qui encourage l'agriculture biologique et locale
- Livraison de paniers de légumes biologiques

Des privilèges pour divers services et activités:

- Rendez-vous sur notre site Internet pour découvrir les offres de notre Programme avantages:
Type d'emploi : Temps plein

Salaire : 32,11$ à 47,70$ par heure

Avantages:

- Assurance Dentaire
- Assurance Invalidité
- Assurance Maladie Complémentaire
- Assurance Vie
- Congés payés
- Garderie sur Place
- Programme d'Aide aux Employés
- Programmes de Bien-être
- Régime de retraite
- Stationnement sur place

Horaires de travail:

- Du Lundi au Vendredi
- Quart de jour

Formation:

- Doctorat



  • Montréal, QC, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront...


  • Montréal, QC H3T 1C5, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront...


  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

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  • Montréal, QC, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront...


  • Montréal, QC, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront...


  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    **Description de l’établissement**: Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique. Ses 5 000 employés et ses 500 médecins, dentistes et pharmaciens œuvrent dans un milieu à la fois hautement innovant, où des connaissances sont...


  • Montréal, Canada Diex Recherche Full time

    Tu cherches à te réinventer en repoussant tes limites à chaque jour et à contribuer aux bien-être de tous en ayant un impact dans la vie des gens? Deviens Diexois/e et participe aujourd'hui à développer le futur, en travaillant en recherche clinique. Votre rôle - Coordonner et planifier la mise en place d’une dizaine de protocoles tout en...


  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    **Description de l’établissement** Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre hospitalier mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique. Associé à l'Université de Montréal, le CHU Sainte-Justine est de loin le plus grand centre de formation en pédiatrie au Québec et un...


  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront...


  • Montréal, Canada Centre de recherche du CHUM - CRCHUM Full time

    À propos du centre de recherche">L'équipe du Centre de recherche du CHUM, affiliée à l'Université de Montréal, s'intéresse à l'élaboration d'études cliniques initiées par les investigateurs dans divers domaines de la santé. En collaboration avec les équipes de recherche translationnelle, nos projets visent à évaluer...


  • Montréal, Canada Centre de recherche du CHUM - CRCHUM Full time

    Ce poste aura pour objectifs de coordonner et de mener des activités de recherche, de formation et d'administration au sein du programme de recherche qualitative et de méthodes mixtes dirigé par le Dr Rodney Knight. Ce programme de recherche porte sur la consommation de substances psychoactives et la santé des jeunes, et englobe plusieurs études...


  • Montréal, Canada Centre de recherche du CHUM - CRCHUM Full time

    Ce poste aura pour objectifs de coordonner et de mener des activités de recherche, de formation et d'administration au sein du programme de recherche qualitative et de méthodes mixtes dirigé par le Dr Rodney Knight. Ce programme de recherche porte sur la consommation de substances psychoactives et la santé des jeunes, et englobe plusieurs études...


  • Montréal, Canada Centre de recherche du CHUM - CRCHUM Full time

    Ce poste aura pour objectifs de coordonner et de mener des activités de recherche, de formation et d'administration au sein du programme de recherche qualitative et de méthodes mixtes dirigé par le Dr Rodney Knight. Ce programme de recherche porte sur la consommation de substances psychoactives et la santé des jeunes, et englobe plusieurs études...


  • Montréal, Canada Centre de recherche du CHUM - CRCHUM Full time

    L’équipe d’Antoine Desilets, MD, MSc s’intéresse à l’élaboration d’études cliniques initiées par l’investigateur au CHUM, ainsi qu’à l’analyse de biomarqueurs génomiques et transcriptomiques de réponse tels qu’identifiés par séquençage génétique de prochaine génération (NGS) et biopsies liquides. En collaboration avec les...


  • Montréal, Canada Centre de recherche du CHUM - CRCHUM Full time

    L’équipe d’Antoine Desilets, MD, MSc s’intéresse à l’élaboration d’études cliniques initiées par l’investigateur au CHUM, ainsi qu’à l’analyse de biomarqueurs génomiques et transcriptomiques de réponse tels qu’identifiés par séquençage génétique de prochaine génération (NGS) et biopsies liquides. En collaboration avec les...


  • Montréal, QC, Canada Ad hoc recherche Full time

    Les défis d'un environnement de travail dynamique et stimulant vous attirent et vous aspirez à travailler en équipe à la recherche d’insights marketing, dans un lieu où vous pourrez découvrir, apprendre et grandir? En tant que technicien(ne) en recherche marketing, vous contribuerez à la réalisation de mandats de recherche marketing diversifiés...

  • Research Associate

    2 months ago


    Montréal, QC, Canada Université de Montréal Full time

    Reporting to the laboratory director Dr. Manousaki, the bioinformatician/data manager will identify and analyze genetic variants from genotyping and sequencing data (exome and whole genome). Using this data, he/she will further develop and implement polygenic risk scores. The research projects explore the impact of genetic variants on complex traits...


  • Montréal, Quebec, Québec, Canada Centre de recherche du CHUM - CRCHUM Full time

    Ce poste aura pour objectifs de coordonner et de mener des activités de recherche, de formation et d'administration au sein du programme de recherche qualitative et de méthodes mixtes dirigé par le Dr Rodney Knight. Ce programme de recherche porte sur la consommation de substances psychoactives et la santé des jeunes, et englobe plusieurs études...


  • Montréal, Quebec, Québec, Canada Centre de recherche du CHUM - CRCHUM Full time

    L’équipe d’Antoine Desilets, MD, MSc s’intéresse à l’élaboration d’études cliniques initiées par l’investigateur au CHUM, ainsi qu’à l’analyse de biomarqueurs génomiques et transcriptomiques de réponse tels qu’identifiés par séquençage génétique de prochaine génération (NGS) et biopsies liquides. En collaboration avec les...