Stage Master 2: Analyse Du Couplage Entre

2 weeks ago

Sherbrooke, Canada Faculté de médecine et des Sciences de la Santé, Université de Sherbrooke Full time

**Stage Master 2: Analyse du couplage entre l'épissage et la polyadénylation à l'aide du séquençage par nanopores**:

- Réf
- **ABG-116038**
- Stage master 2 / Ingénieur- Durée 6 mois- Salaire net mensuel 1500$ CAD- 25/07/2023- Faculté de médecine et des Sciences de la Santé, Université de Sherbrooke- Lieu de travail- Sherbrooke Canada- Champs scientifiques- Biologie
- Informatique
- Mots clés- séquençage par nanopores, épissage, polyadénylation, transcriptomique-
- 15/09/2023**Établissement recruteur**:
**Site web**:

- Les laboratoires Choquet et Bachand sont situés au sein du Département de biochimie et génomique fonctionnelle à l’Université de Sherbrooke. Ce département comporte une douzaine de groupes de recherche dont les laboratoires sont tous situés au Pavillon de recherche appliquée sur le cancer, favorisant les interactions et collaborations entre membres de laboratoires différents. Nos stagiaires et étudiant(e)s en bio-informatique travaillent dans un environnement de bureau ouvert avec un ordinateur à chaque poste de travail. Nous utilisons les superordinateurs de Calculs Canada pour nos calculs intensifs. Sherbrooke est une ville dynamique dans le sud-est du Québec, une région reconnue pour le plein-air et les activités récréatives tant en été qu’en hiver.**Description**:

- La maturation de l’ARN est un processus complexe impliquant plusieurs étapes, dont l’excision des nombreux introns par le processus de l’épissage et l’addition d’une queue de poly(A). Au cours des dernières années, plusieurs études ont démontré que ces processus ne sont pas indépendants. Au contraire, ils s’influencent pour déterminer l’identité de l’ARN mature. Nous nous intéressons au couplage entre les différentes étapes de maturation des ARN messagers (ARNm) et des long ARNs non-codants. Nous cherchons notamment à comprendre les mécanismes contrôlant le couplage entre l’épissage et la polyadénylation au sein d’un même transcrit dans les cellules humaines. Pour ce faire, nous utilisons le séquençage direct d’ARN par nanopores. Cette approche génère de longues lectures qui permettent d’étudier simultanément plusieurs étapes de la maturation de l’ARN telles que l’épissage et la polyadénylation. Par exemple, nous avons récemment démontré que l’épissage post-transcriptionnel et la polyadénylation progressent en parallèle plutôt qu’un après l’autre (1). Nous étudions également le rôle de la protéine PABPN1, qui est impliquée dans la dystrophie musculaire oculopharyngée, dans la régulation de ces processus. En plus de sa fonction comme protéine liant les queues de poly(A), nos résultats démontrent que PABPN1 régule l’épissage des introns terminaux dans les cellules humaines (2).- L’objectif de ce stage sera d’analyser des données de séquençage par nanopores afin de résoudre des questions biologiques reliées à la fonction de PABPN1 dans l’épissage et la polyadénylation des ARNm et des ARNs non-codants. Le stage se fera en co-supervision entre les laboratoires de Karine Choquet et de François Bachand. Le laboratoire Choquet se spécialise en génomique fonctionnelle et en transcriptomique, générant et analysant des ensembles de données de séquençage de prochaine génération et de séquençage par nanopores. Nous analysons ces données à l’aide de méthodes bio-informatiques et informatiques. Le laboratoire Bachand utilise des approches génétiques, biochimiques, génomiques et protéomiques afin de résoudre les mécanismes moléculaires par lesquels les protéines liant l’ARN favorisent des fonctions spécialisées dans les cellules saines et malades.- Publications d’intérêt:
- 1. Choquet K, Baxter-Koenigs AR, Dülk SL, Smalec BM, Rouskin S, Churchman LS (2023) Pre-mRNA splicing order is predetermined and maintains splicing fidelity across multi-intronic transcripts.
- _Nat Struct Mol Biol_.- 2. Kwiatek L, Voyer-Landry AM, Latour M, Yague-Sanz C, Bachand F (2023) PABPN1 prevents the nuclear export of an unspliced RNA with a constitutive transport element and controls human gene expression via intron retention.
- _RNA,_
- 29_, 644-629.- 3. Beaulieu YB, Kleinman CL, Voyer-Landry AM, Majewski J, Bachand F (2012) Polyadenylation-dependent control of long noncoding RNA expression by the poly(A)-binding protein nuclear 1.
- _PLoS Genetics_,
- _8_, e1003078.- **Profil**:
Étudiant(e) en bio-informatique, informatique, génomique ou dans les sciences biologiques qui connaît la programmation en Python et/ou R. Une expérience en analyse de RNA-seq et/ou de séquençage par nanopores est un atout.

**Prise de fonction**:

- 08/01/2024

  • Automne 2024 - Stage en électricité du bâtiment

    1 week ago

    Sherbrooke, Canada CIMA+ Full time

    Description du posteMissionLa personne en stage aidera les membres de l'équipe bâtiment à élaborer des solutions adaptées aux besoins des clients, en participant à la conception de systèmes électriques de bâtiments institutionnels et commerciaux.Tes responsabilités:Aider à la conception des projets variés de type institutionnel, commercial ou...

  • Coordonnateur / Scrum Master Recherche Et

    7 days ago

    Sherbrooke, Canada Harris Computer Systems Full time

    Offre d’emploi - Coordonnateur / Scrum master recherche et développement Nous sommes à la recherche d’un coordonnateur/scrum master pour notre équipe de Recherche et développement. Sous la supervision de la direction du développement, le coordonnateur/scrum master contribue à la planification, à l’organisation et au suivi de l’ensemble des...

  • Stage au laboratoire

    2 weeks ago

    Sherbrooke, Canada Tekna Full time

    SOMMAIRE DU POSTE Le ou la titulaire du stage ou du poste temporaire sera responsable de l’analyse des poudres de microélectronique et de participer à l’amélioration des techniques d’analyses. VOTRE RÔLE DANS L'ENTREPRISE Participation au contrôle qualité sur les nanopoudres métalliques utiliser en microélectronique en utilisant les...

  • Stage au laboratoire

    2 weeks ago

    Sherbrooke, Canada Tekna Full time

    SOMMAIRE DU POSTE Le ou la titulaire du stage ou du poste temporaire sera responsable de l’analyse des poudres de microélectronique et de participer à l’amélioration des techniques d’analyses. VOTRE RÔLE DANS L'ENTREPRISE Participation au contrôle qualité sur les nanopoudres métalliques utiliser en microélectronique en utilisant les...

  • Analyse Financier Et Projets Spéciaux

    4 weeks ago

    Sherbrooke, Canada Bravad Full time

    Sous la responsabilité du Directeur des Finances, l’Analyste Finances et Projets Spéciaux aura pour principale responsabilité de participer à tous les aspects liés à la comptabilité et les opérations financières des différentes compagnies du Groupe Bravad, tout en assurant la pleine transparence et fiabilité des résultats financiers. Il...

  • Agent ou agente de la gestion du personnel | Gestion des effectifs

    6 days ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS du Centre-Ouest-de-l'Île-de-Montréal Full time

    Établissement : CIUSSS de l’Estrie – CHUS Titre d'emploi : Agent ou agente de la gestion du personnel | Gestion des effectifs Direction : Direction des ressources humaines (DRH) Ville de l'emploi : Sherbrooke Installation : Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke Nombre de jours : Type de poste : Personnel non syndiqué Statut de...

  • Stage au laboratoire

    2 weeks ago

    Sherbrooke, QC, H1W, Montréal, Canada Tekna Full time

    SOMMAIRE DU POSTE Le ou la titulaire du stage ou du poste temporaire sera responsable de l’analyse des poudres de microélectronique et de participer à l’amélioration des techniques d’analyses. VOTRE RÔLE DANS L'ENTREPRISE Participation au contrôle qualité sur les nanopoudres métalliques utiliser en microélectronique en utilisant les...

  • Agent ou agente de la gestion du personnel | Attraction et dotation

    7 days ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS du Centre-Ouest-de-l'Île-de-Montréal Full time

    Établissement : CIUSSS de l’Estrie – CHUS Titre d'emploi : Agent ou agente de la gestion du personnel | Attraction et dotation Direction : Direction des ressources humaines (DRH) Ville de l'emploi : Sherbrooke Installation : Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke Nombre de jours : Type de poste : Personnel non syndiqué Statut de...

  • Agent ou agente de la gestion du personnel | Prévention

    6 days ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS du Centre-Ouest-de-l'Île-de-Montréal Full time

    Établissement : CIUSSS de l’Estrie – CHUS Titre d'emploi : Agent ou agente de la gestion du personnel | Prévention Direction : Direction des ressources humaines (DRH) Ville de l'emploi : Sherbrooke Installation : Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke Nombre de jours : Type de poste : Personnel non syndiqué Statut de l’emploi :...

  • Automne 2024 - Stage en Structure de Bâtiment

    3 days ago

    Sherbrooke, Canada CIMA+ Full time

    **Description de l'entreprise** Bienvenue là où l’humain est au cœur de tout. Bienvenue aux gens qui aiment les gens, aux cerveaux lumineux, à celles et ceux qui ont des visions d’avenir inspirantes, qui recherchent des défis stimulants, qui ont la fibre collaborative et l’esprit entrepreneurial dans leur ADN. Chez CIMA+, vous découvrirez un...

  • Agent ou Agente de La Gestion Du Personnel Gestion

    7 days ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS Estrie Full time

    **Établissement**: CIUSSS de l'Estrie - CHUS **Titre d'emploi**: Agent ou agente de la gestion du personnel | Gestion des effectifs **Direction**: Direction des ressources humaines (DRH) **Ville de l'emploi**: Sherbrooke **Installation**: Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke **Nombre de jours**:Type de poste**: Personnel non...

  • Agent ou agente de la gestion du personnel | Assurance salaire

    2 weeks ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS du Centre-Ouest-de-l'Île-de-Montréal Full time

    Établissement : CIUSSS de l’Estrie – CHUS Titre d'emploi : Agent ou agente de la gestion du personnel | Assurance salaire Direction : Direction des ressources humaines (DRH) Ville de l'emploi : Sherbrooke et environs Installation : Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke Nombre de jours : Type de poste : Personnel non syndiqué Statut de...

  • Agent ou Agente de La Gestion Du Personnel Dotation

    3 days ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS de l’Estrie – CHUS Full time

    **Établissement**: CIUSSS de l’Estrie - CHUS **Titre d'emploi**: Agent ou agente de la gestion du personnel | Dotation et mouvements internes **Direction**: Direction des ressources humaines (DRH) **Ville de l'emploi**: Sherbrooke **Installation**: Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke **Type de poste**: Personnel non syndiqué **Statut de...

  • Automne 2024 - Stage en structure de bâtiment - Hybride

    3 weeks ago

    Sherbrooke, Canada CIMA+ Full time

    Description du posteMission :Nous sommes à la recherche d’un esprit ingénieux pour se joindre à notre équipe en structure de bâtiment. Cette personne viendra participer activement à la conception et à la préparation des plans et devis de projets en structure de bâtiment.  Principales responsabilités :Participer activement à la conception et à...

  • Associate Business Systems Analyst

    3 days ago

    Sherbrooke, Canada Wolters Kluwer Full time

    Wolters Kluwer est un fournisseur mondial de solutions client innovatrices et intégrées qui soutiennent le flux de travail des comptables, des services de comptabilité et de fiscalité des sociétés et des auditeurs afin de favoriser leur croissance ainsi que l'augmentation de leur rendement et de leurs profits. Plus de 20 000 bureaux comptables, dont...

  • Agent ou Agente de La Gestion Du Personnel Gest

    4 weeks ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS de l’Estrie – CHUS Full time

    **Établissement**: CIUSSS de l’Estrie - CHUS **Titre d'emploi**: Agent ou agente de la gestion du personnel | GEST DEVELOP COMP **Direction**: Direction des ressources humaines, communications et affaires juridiques (DRHCAJ) **Ville de l'emploi**: Sherbrooke **Installation**: Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke **Type de poste**: Personnel...

  • Agent ou Agente de La Gestion Du Personnel

    7 days ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS Estrie Full time

    **Établissement**: CIUSSS de l'Estrie - CHUS **Titre d'emploi**: Agent ou agente de la gestion du personnel | Attraction et dotation **Direction**: Direction des ressources humaines (DRH) **Ville de l'emploi**: Sherbrooke **Installation**: Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke **Nombre de jours**:Type de poste**: Personnel non...

  • Agent ou agente de la gestion du personnel | Relation de travail

    1 week ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS du Centre-Ouest-de-l'Île-de-Montréal Full time

    Établissement : CIUSSS de l’Estrie – CHUS Titre d'emploi : Agent ou agente de la gestion du personnel | Relation de travail Direction : Direction des ressources humaines (DRH) Ville de l'emploi : Sherbrooke Installation : Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke Nombre de jours : Type de poste : Personnel non syndiqué Statut de...

  • Directeur(trice) - Planification et analyse financières

    1 week ago

    Sherbrooke, Canada Global Excel Management Inc Full time

    Description Vous êtes une personne avec de solides compétences en analyse et capable d’effectuer plusieurs tâches à la fois? Vous souhaitez travailler dans un milieu multilingue et accueillant qui encourage le développement personnel et professionnel? Nous voulons vous rencontrer! En tant que directeur de la planification et de l’analyse...

  • Technologue en imagerie médicale du domaine du radiodiagnostic

    3 weeks ago

    Sherbrooke, Canada CIUSSS du Centre-Ouest-de-l'Île-de-Montréal Full time

    Établissement : CIUSSS de l’Estrie – CHUS Titre d'emploi : Technologue en imagerie médicale du domaine du radiodiagnostic Direction : Direction des services multidisciplinaires (DSM) Ville de l'emploi : Sherbrooke et environs Installation : Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke Nombre de jours : Variable Type de poste : Personnel...