Bioinformaticien(Ne) de Recherche Niveau 3

3 weeks ago


Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

**Description de l’établissement**:
Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre hospitalier mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique. Associé à l'Université de Montréal, le CHU Sainte-Justine est de loin le plus grand centre de formation en pédiatrie au Québec et un chef de file au Canada. Chaque jour, ce sont près de 7 000 personnes engagées - spécialistes en soins infirmiers, en réadaptation physique, en santé psychosociale, en recherche et en administration, médecins, dentistes, pharmaciennes et pharmaciens, stagiaires et bénévoles - qui, inspirées par une tradition d’innovation, collaborent afin de transformer la vie de générations.

**Description du poste**:
Le CHUSJ et l’Hospital for Sick Children (SickKids) de Toronto ont récemment mis sur pied un partenariat de recherche qui vise à transformer les soins pédiatriques via le développement de nouveaux paradigmes en santé de précision. Ce partenariat sans précédent dans l’histoire canadienne s’appuiera sur la création de synergies centrées sur l’utilisation de technologies de pointe et le partage et l’exploitation de grands jeux de données. Le CHUSJ recherche un bioinformaticien pour soutenir le développement du volet de génomique translationnelle de ce partenariat.

**Le bioinformaticien aura la responsabilité de**:

- Mettre en place des pipelines qui permettent d’identifier, annoter et analyser des variants génétiques et épigénétiques à partir de données de séquençage (génome complet et transcriptome). Les données à analyser proviendront du séquençage de courte lecture (systèmes NovaSeq 6000 et NovaSeq X Plus d’Illumina) et de longue lecture (systèmes Revio de PacBio et Promethion d’Oxford Nanopore);
- Réaliser différentes analyses bioinformatiques à partir des jeux de données générés par les séquenceurs de nouvelle génération;
- Organiser les réunions de l’équipe de projet, participer aux décisions opérationnelles et aider à la rédaction des articles et publication des projets;
- S’assurer de la bonne marche de l’étude, du suivi du protocole et de la qualité des données ;
- Développement et rédaction des procédures de traitement des données dans le laboratoire, ainsi que la mise en place du système d’analyse;
- Organisation, hiérarchisation et archivage des données sur les serveurs;
- Documentation et communication sur le processus d’analyse, résultats, outils et techniques utilisés;
- Interaction avec les membres du laboratoire afin d’élaborer des stratégies d’analyses.

**Exigences**:

- Niveau d’études : Diplôme universitaire en bioinformatique ou dans un domaine pertinent;
- Expérience en programmation avec les langages Bash et Python dans un environnement Linux;
- Connaissance et/ou expérience avec NextFlow, YAML ou WDL;
- Expérience en processus d’analyse sur des grappes de calculs HPC ou infonuagiques;
- Expérience avec des banques de données SQL;
- Proactif et capable de travailler de façon indépendante avec supervision mínimale;
- Capacité de travailler en groupe sur plusieurs projets;
- Excellente gestion des priorités, rapidité d’exécution, sens de l’organisation et gestion du temps;
- Bonne compétence en gestion de données.

**Conditions d’emploi**
Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR)
Échelle salariale: Niveau 3 - entre 28.67$/hr et 42.58$/hr
Chercheur responsable: Dr Jacques Michaud
Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)
Date prévue d’entrée en fonction : Immédiate
- Remarques : _

Autres avantages:
**FAIRE CARRIÈRE CHEZ NOUS C’EST**:

- Contribuer à une mission humaine qui a pour but d’améliorer la santé des mères et des enfants du Québec;
- S’investir avec une équipe de travail innovatrice, motivée par des projets en constante évolution;
- Avoir la possibilité de se réaliser à travers des défis stimulants;
- S’offrir une carrière à la hauteur de ses compétences dans un milieu constamment en mouvement;
- Évoluer dans une organisation qui valorise l’amélioration continue;
- Se réaliser professionnellement grâce aux multiples possibilités de développement.

Type d'emploi : Temps plein

Rémunération : 28,67$ à 42,58$ par heure

Avantages:

- Assurance Dentaire
- Assurance Invalidité
- Assurance Maladie Complémentaire
- Assurance Vie
- Congés payés
- Garderie sur Place
- Programme d'Aide aux Employés
- Programmes de Bien-être
- Stationnement sur place

Horaires de travail:

- Quart de jour

Lieu du poste : En présentiel



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  • Montréal, Canada McGill University Full time

    Veuillez référer au guide pour obtenir des instructions sur la façon de postuler. Si vous êtes un employé actif de McGill (c.à-d. actuellement dans un contrat ou un poste actif à l'Université McGill), ne postulez pas via ce site de carrière. Connectez-vous à votre compte McGill Workday et postulez à cette affichage en utilisant le rapport Find...


  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    Le Centre de recherche Azrieli du CHUSJ est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront d’innombrables...


  • Montréal, Canada Institut de Cardiologie de Montréal Full time

    Technicien(ne) de recherche **Technicien(ne) de recherche** **Laboratoire d’histologie et immunohistochimie** **Temps partiel, 3 jours par semaine** Affilié à l’Université de Montréal_, _**_l’Institut de cardiologie de Montréal_** est un centre hospitalier ultraspécialisé en cardiologie consacré aux soins, à la recherche, à...


  • Montréal, Canada Impact Recherche Full time

    Chez Impact, la branche recherche de Plus Compagnie, notre objectif est de mener des études qui parlent au nom des consommateurs en se concentrant sur les mentalités, les émotions et les motivations. Nous sommes fiers d'apporter une approche personnalisée à tous les projets, en adaptant toujours nos solutions aux besoins de nos clients et aux parcours...


  • Montréal, Canada Institut de Cardiologie de Montréal Full time

    Laboratoire d’histologie et immunohistochimie Temps partiel, 3 jours par semaine Affilié à l’Université de Montréal, l’Institut de cardiologie de Montréal est un centre hospitalier ultraspécialisé en cardiologie consacré aux soins, à la recherche, à l’enseignement, à la prévention, à la réadaptation ainsi qu’à l’évaluation des...


  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    **Projet** - Coordonner la réalisation du projet à ses différentes étapes; - Contribuer à la fois aux aspects méthodologiques et scientifiques du projet; - Effectuer la supervision d’une équipe d’assistants de recherche; - Assurer le suivi et la communication auprès des partenaires et collaborateurs; - Contribuer au maintien de communications...


  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    **Description du poste**: Centre de Soutien à la Recherche Clinique (CSRC) Le Centre de recherche du CHU Ste-Justine est présentement à la recherche d’un coordonnateur de recherche pour se joindre au Centre de Soutien à la Recherche Clinique (CSRC). Il sera impliqué majoritairement sur des protocoles de recherche académiques en...


  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    Le Centre de Soutien à la Recherche Clinique (CSRC) est à la recherche d’un coordonnateur de recherche clinique pour travailler principalement sur la mise en place d’une biobanque de spécimens biologiques et de données portant sur les malformations digestives telles que l’atrésie de l’œsophage, la maladie de Hirschsprung ou les malformations...


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  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    **Description de l’établissement**: Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique. Ses 5 000 employés et ses 500 médecins, dentistes et pharmaciens œuvrent dans un milieu à la fois hautement innovant, où des connaissances sont...


  • Montréal, Canada Étude de recherche Full time

    **ASSISTANT(E) de RECHERCHE** **Description du poste** Sous l'autorité du coordonnateur de l'étude, le ou la titulaire de ce poste exécutera diverses tâches liées aux visites de l’étude en cours. Ces tâches, réalisées en présentiel, consistent à assister l’infirmière de recherche dans la préparation et la réalisation des visites des...


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    **Description de l’établissement**: Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre hospitalier mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique. Associé à l'Université de Montréal, le CHU Sainte-Justine est de loin le plus grand centre de formation en pédiatrie au Québec et un...


  • Montréal, Canada CHU Sainte-Justine Full time

    **Description du poste**: Description sommaire Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est un établissement phare en recherche mère-enfant au Canada affilié à l’Université de Montréal. Il nourrit la vision de faire du Québec un lieu où la santé des mères, des enfants et des adolescents compte parmi les meilleurs au monde. Le tout...


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  • Montréal, Canada Groupe Somavrac Full time

    Groupe Somavrac est une entreprise familiale bien établie aux quatre coins du Québec. Nous sommes des experts en manutention logistique pour le compte de multinationales et nous distribuons également des produits chimiques. Chez Groupe Somavrac l’humain est au cœur de nos décisions. Nous nous entourons de gens qui sont, comme nous, des joueurs...


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