Bioinformaticien/ Bioinformatician

**À propos de CellCarta**

CellCarta est un important fournisseur de services de laboratoire spécialisés en médecine de précision pour l'industrie biopharmaceutique. Grâce à ses plateformes analytiques intégrées en immunologie, histopathologie, protéomique et génomique, ainsi qu'à ses services connexes de collecte d'échantillons et de logistique, CellCarta soutient l'ensemble du cycle de développement des médicaments, de la découverte aux essais cliniques avancés. La société opère à l'échelle mondiale avec 11 installations situées au Canada, aux États-Unis, en Belgique, en Australie et en Chine.

**Sommaire**

**Responsabilités principals**
- Effectuer l'analyse des données de spectrométrie de masse à l'aide des logiciels Elucidator et PEAKS, Mascot, OMSSA, XTandem, Peptide/Protein Prophet, etc ;
- Évaluer les annotations de protéines et les bases de données de spectrométrie de masse en protéomique ;
- Fournir des annotations biologiques, et automatiser leur extraction, leur analyse, leur transformation et leur chargement à partir de bases de données publiques ou internes;
- Proposer et mettre en œuvre de nouvelles procédures de contrôle de la qualité et d'analyse des données ;
- Fournir une visualisation claire et un résumé des résultats d'analyse ;
- Fournir des recommandations scientifiques sur la manière d'améliorer la qualité des résultats et le débit de la plateforme de recherche ;
- Effectuer des analyses ad hoc pour évaluer la qualité des données ou améliorer la compréhension des résultats ;
- Rédiger et réviser les sections des protocoles et des rapports d'étude ;
- Effectuer des activités de gestion des données selon les besoins, y compris la compilation des données et la révision du CQ.

**Éducation**
- MSc. ou Ph.D. en bioinformatique ou dans un domaine d'étude connexe.

**Compétences et experience requis**
- Trois ans d'expérience professionnelle en protéomique ou dans un domaine connexe de la bioinformatique ;
- Connaissance d'un langage de programmation comme R, Python, SQL ou SAS ;
- Expérience des bases de données relationnelles telles que Oracle, SQL Server ou MySQL ;
- Solide compréhension de la biologie moléculaire, de la protéomique et de la spectrométrie de masse ;
- Solides compétences en communication orale et écrite pour faire des présentations internes et aux clients ;
- Bonne tenue de dossiers, attention aux détails et engagement à réaliser un travail de bonne qualité ;
- Excellentes compétences interpersonnelles et capacité à travailler en collaboration au sein d'une équipe de recherche multidisciplinaire ;
- Excellent sens de l'organisation et capacité à établir des priorités et à mener plusieurs tâches de front.
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**About CellCarta**

**CellCarta** is a leading provider of specialized precision medicine laboratory services to the biopharmaceutical industry. Leveraging its integrated analytical platforms in immunology, histopathology, proteomics and genomics, as well as related specimen collection and logistics services, CellCarta supports the entire drug development cycle, from discovery to late-stage clinical trials. The company operates globally with over 800 employees in its nine facilities located in Canada, USA, Belgium, Australia, and China.

**Summary**

**Responsibilities**
- Perform analysis of mass spectrometry data using the Elucidator and PEAKS software, Mascot, OMSSA, XTandem, Peptide/Protein Prophet, etc.;
- Evaluate protein annotations and proteomics mass spectrometry databases;
- Provide biological annotations, and automate their extraction, parsing, transformation and loading from public or in-house databases;
- Propose and implement novel quality control and data analysis procedures;
- Provide clear visualization and summary of analysis results;
- Provide scientific recommendations on how to improve the quality of the results and the throughput of the research platform;
- Perform ad-hoc analysis to evaluate data quality or improve the understanding of the results;
- Write and review sections for protocols and study reports;
- Perform Data Management activities as needed, including data compilation and QC review.

**Education**
- MSc. or Ph.D. in Bioinformatics or related field of study.

**Main Requirements**
- Three years of work experience in proteomics or related bioinformatics field;
- Knowledge of programming language like R, Python, SQL or SAS;
- Experience with relational databases such as Oracle, SQL Server or MySQL;
- Solid understanding of molecular biology, proteomics and mass spectrometry;
- Strong oral and written communication skills to make internal and client presentations;
- Good record keeping, attention to details and commitment to achieve good quality work;
- Excellent interpersonal skills and ability to work collaboratively as part of a multidisciplinary research team;
- Excellent organisational skills and ability to prioritise and